Le littoral fait transition entre terres émergées et océan ouvert ; l'océan y impacte l'activité humaine, et la pression anthropique sur le milieu marin y est exacerbée. Via une approche globale du patrimoine côtier et des vestiges immergés et submergés, les objectifs visent une caractérisation des forçages se produisant aux interfaces, une quantification des pressions anthropiques passées, une analyse des réponses des composantes physiques et biologiques des systèmes côtiers et littoraux, et une évaluation de l’impact des variables anthropiques et naturelles sur l’avenir du patrimoine archéologique. La compréhension de la réponse du milieu (les ressources et leur exploitation), et de l'adaptation des activités humaines constitue un second enjeu qui débouchera sur des modèles prédictifs et des stratégies de gestion des milieux côtiers et littoraux.
Une approche systémique portant sur des sociétés littorales et des territoires spécifiques : îles, archipels, estuaires… sera valorisée, de même que le développement de l’archéologie portuaire sur les façades de la Manche et de l’Atlantique, en combinant les ressources de l’archéologie terrestre, intertidale et sous-marine. La recherche sur les façades Manche et Atlantique s’enrichit d’une comparaison avec d’autres espaces maritimes.